目前，Windows 95 OSR2 以後的操作系統都支持這種分區格式。但是，這種分區格式也有它的缺點。
首先是採用FAT32 格式分區的磁盤，由於文件分配表的擴大，運行速度比採用FAT16 格式分區的磁盤要慢。
另外，由於 DOS 和Windows 95 不支持這種分區格式，所以採用這種分區格式後，將無法再使用 DOS 和Windows 95 系統。
系統盤即C盤用fat32的格式.這樣它的安全級別最高~而其他的盤用ntfs格式~因為ntfs比fat格式除安全方面其他的都比它的功能強大~
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