神原拓也、源輝二、織本泉、冰見友樹、柴山純平、木村輝一六位孩子受到神聖天女獸的召喚,進入數碼寶貝世界,利用鬥士精神進化成數碼寶貝拯救了世界。
2002年,數碼世界面臨滅亡的危機!數碼世界本是由究極天使獸、基路比獸及神聖天女獸三大天使所管治的,然而其中一位天使——基路比獸卻叛變,這使得數碼世界的平衡受到破壞,並開始崩潰……
古代曾經拯救數碼暴龍世界的十鬥士現在已不存在。就在這危急關頭,十鬥士的鬥士精神把新力量給予了另一個世界——現實世界的孩子……
主角拓也等人,將進入數碼世界,變身成數碼寶貝,投入這場冒險與戰鬥的旅程!