通過扣繳義務人申報和綜合所得年度自行申報區別區別在於：通過扣繳義務人申報的，意味着通過公司來代扣，適合上班族，選擇這項後單位會獲得你的申報信息，幫你申報幫你代扣，年終不需要再進行核算和申報，對於上班族來説比較省事。
綜合所得指的是工資薪金所得、勞務費收入所得、稿酬所得、特許權使用費所得四項收入合一的綜合收入，這種方式預扣預繳的税率非常高。
扣繳義務人申報和綜合所得年度自行申報區別如下：
1、通過扣繳義務人申報，是由扣繳義務人（任職單位）按月幫你預扣預繳，如果納税人申請了子女教育專項附加扣除，任職單位每個月給納税人發放工資時候，會對子女教育專項附加扣除進行預扣，當月就能享受到減税福利
2、綜合所得年度自行申報，是由納税人在每個納税年度結束後自行進行申報辦理，在下一年享受税收優惠。
《中華人民共和國個人所得税法》
第十一條
居民個人取得綜合所得，按年計算個人所得税有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次預扣預繳税款需要辦理彙算清繳的，應當在取得所得的次年三月一日至六月三十日內辦理彙算清繳。預扣預繳辦法由國務院税務主管部門制定。
居民個人向扣繳義務人提供專項附加扣除信息的，扣繳義務人按月預扣預繳税款時應當按照規定予以扣除，不得拒絕。
非居民個人取得工資、薪金所得，勞務報酬所得，稿酬所得和特許權使用費所得，有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次代扣代繳税款，不辦理彙算清繳。
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