金魚的種種顏色,主要是由於真皮層中許多有色素細胞所產生的。金魚的顏色成分其實只有3種:黑、黃和蘭。大多數色素細胞的色素位置是會變化的。家養金魚鮮豔多變的體色,只不過是這3種成分的重新組合分佈而已。
所以金魚的個體發育過程中,常有褪色現象,各種金魚的幼魚階段幾乎是差不多的灰褐色,由於色素細胞的部分消失而轉變成成魚的體色。 黑色金魚則因黑色色素細胞增加而形成黑色,在2-3年內會褪成橙紅色。
橙紅色金魚則常褪成白色。有些魚則體表沒有色素細胞,褪色後就成為透明魚。而褪色過程的中間狀態就形成了雜色金魚。這其實就是很複雜的體色遺傳的結果。