兩者的成分有所不同，如果防水砂漿裏面還添加了防水劑，或者有一些乳化劑等等，能夠達到防水的效果。而普通砂漿是水泥和水攪拌均勻，裏面還有一些石膏，所以成分有很大的區別。
2、用途也有所不同，如果是防水砂漿，一般來説它可以用於內外牆的塗抹，尤其是外牆使用，範圍更加廣泛，包括地下室或者水塔都可以使用，因為它的防水性能更加突出一些，包括水利電工程，因為有防水作用，所以被廣為運用。
普通砂漿一般來説可以用於砌牆或者抹灰使用，而使用範圍有所限制。
區別是：防水砂漿是多種聚合物、添加劑、乳液等材料調配組合而成的，是一種高分子的防水防潮材料。
普通砂漿是精細骨料、水泥基和水按照比例攪拌而成，也稱為灰漿防水砂漿常常用於建築的內外牆防水，例如隧道、牆地面、地下室、大壩等。普通砂漿用於砌築和抹灰工程的防水、防護、粘結、砌築等施工。
普通砂漿與防水砂漿的區別在於是否採用聚合物膠乳起功能性防水作用。
也就是説，普通砂漿是通過優化級配或同時添加無機鋁鹽等防水劑，達到密實防水效果。
而防水砂漿是通過在砂漿中摻入一定比例的丙烯酯、EVA等膠乳，起到防水作用。
在性能上，防水砂漿的抗折性能與粘結強度等指標一般高於普通砂漿。
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