北京南站的開車從南進站口和北進站口都方便。另外北京南站的東西兩側各有一個停車場,同時可以停放近千輛小型汽車,東西停車場的出入口,都可以進入車,且在這兩個出停車場內分別都各有兩層,通過停車場地下一層的東西通道即可到達車站的換乘層。