1、防治魚病：硫酸銅可用於治療原生動物引起的魚病，如卵鞭蟲病、隱鞭蟲病、魚波豆蟲病、毛管蟲病、斜管蟲病、車輪蟲病等。以及甲殼動物引起的魚病，如中 華魚蚤病。全池潑灑的用藥濃度：春、秋季為0.7毫克/升（硫酸銅與硫酸亞鐵按5:2配製），夏季應降到0.5-0.6毫克/升。用藥時間儘量選擇晴天午後進行，全池均勻潑灑，用藥後要做好解救魚浮頭的準備工作。
2、魚種藥浴：常用藥浴濃度為8毫克/升（硫酸銅與硫酸亞鐵按5:2配製），或硫酸銅8毫克/升加漂白粉10毫克/升，藥浴10-30分鐘，這2種配方均可殺滅魚體表和鰓上的細菌、原蟲，對未形成胞囊的粘胞子蟲也有效。
3、工具、食物消毒：漁具用20毫克/升硫酸銅溶液浸泡半小時，可殺滅原蟲。食場消毒可在魚病流行季節定期進行，每次用硫酸銅100克、硫酸亞鐵40 克，溶於水後潑灑在食場周圍，面積控制在80-100平方米，先潑藥後上食，每天1次，連用2-3天，以防治原生動物性疾病。
4、控制有害藻類：硫酸銅可用於防治微囊藻、卵甲藻引起的魚類中毒。全池潑灑的用藥濃度為7毫克/升（硫酸銅與硫酸亞鐵按5:2配製），用藥後要及時開動增氧 機，或在第2天清晨適當加註清水，防止藻類死亡後產生的有毒物質引起魚類中毒。用濃度為0.7毫克/升（硫酸銅與硫酸亞鐵按5:2配製），全池潑灑，還能 清除青泥苔及絲狀藻類附着引起的魚、蝦、蟹及螺蚌的病害。
硫酸銅既是一種肥料，又是一種古老而普遍使用的殺菌劑。在蔬菜栽培中，茄子黃萎病、番茄青枯病、黃瓜枯萎病等等，都可用硫酸銅來防治，防治方法有以下的幾種：
1、在蔬菜作物定植時，每畝用硫酸銅1.5-2公斤，摻入碳酸氫銨8-10公斤，拌勻後悶放12-20小時，即為銅銨製劑，定植前均勻地撒入定植溝內或栽植穴裏，然後再栽植菜苗。
2、在菜苗定植緩苗後，用上述配好的銅銨製劑用水溶解，隨水衝入菜田，或直接用硫酸銅每畝2-3公斤隨水澆入菜田，或者用500倍的硫酸銅溶液澆灌蔬菜作物根部，每株用藥液250毫升，防治由土傳病害引發的死苗效果較好。
3、在大田發現蔬菜發病後，每公斤硫酸銅對水500公斤澆灌作物根部，或者用100倍的硫酸銅液塗抹感病植株的病部，防治病害的效果較好。
在使用硫酸銅時必須注意以下事項：
（1）、 硫酸銅的毒性與水温成正比，因此一般應在晴天上午使用效果較好，依水温相對減少用量
（2）、硫酸銅的用量與水體肥度、有機物和懸浮物含量、鹽度、PH值成正比，因此在使用過程中要視池塘的具體情況選擇適當的用量
（3）、水體呈鹼性時慎用硫酸銅，以免形成氧化銅毒死魚類
（4）、硫酸銅對魚類等水生動物的安全濃度範圍較小，毒性較大（尤其對魚苗），因此在使用時應準確計算用量
（5）、溶解時勿用金屬器皿，勿用60℃以上的水，以防失去藥效，投藥後應充分增氧，防止死亡藻類消耗氧氣，影響水質，導致泛塘
（6）、硫酸銅有一定的毒副作用（如造血功能、攝食與生長等）和殘留積累作用，故不能經常使用
（7）、治療小瓜蟲病、打粉病時切忌使用硫酸銅。
硫酸銅中毒主要是引起魚類紅細胞和白細胞減少，肝、腎壞死，破壞造血組織，一旦發生硫酸銅中毒現象應及時加換新水，並全池潑灑水質保護解毒劑。
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