二者的主要區別有兩點,一是開眼的條件不相同,二是能力的大小不一樣。
輪迴眼不需要六道之力就可以開眼,例如宇智波斑沒有六道之力,依然開啟了輪迴眼。
勾玉輪迴眼只有一部分六道之力才可以開啟。例如宇智波佐助的是擁有了六道陰之力,才開啟了勾玉輪迴眼。
另外,勾玉輪迴眼的能力要比普通輪迴眼的能力強得多。
輪迴眼是普通的輪迴眼是寫輪眼進化來的,勾玉輪迴眼是輪迴眼轉變的能力上比輪迴眼強了不止一點點,勾玉輪迴眼在眼睛的波紋上有類似逗號的勾玉。