轉錄水平的調控主要是通過反式作用因子、順式作用元件和RNA聚合酶的相互作用來完成的,主要是反式作用因子結合順式作用元件後影響轉錄起始複合物的形成過程.
轉錄水平調控是真核基因表達調控的重要環節。根據真核基因表達是否受環境影響可分為:發育調控和瞬時調控。其中發育調控是指真核生物為確保自身生長、發育、分化等對基因表達按“預定”和“有序”的程序進行的調控,是不可逆的過程瞬時調控是指真核生物在內、外環境的刺激下所做出的適應性轉錄調控,是可逆過程。