兩個在性質上有明顯不同。黨內分工是指黨內職務中的分工,主要是書記(副書記)、委員的分工,主要有組織委員、宣傳委員、紀律委員等,側重於黨的組織體制內。
行政分工是行政管理中的分工,是對如生產、安全、教育、人事、財務等行政性事務的管理分工,側重於管理。