因為“使徒”是地球上真正的“正統居民”為了拿走地球的生存權。
根據劇情，使徒乃是出生於生命之源“亞當”的卵“白之月”（位於南極），而人類則出生於另一生命之源“莉莉斯”的卵“黑之月”（位於日本第3新東京市的球形地下空洞，即NERV本部的所在地），所以使徒可以視作“另一種人類”。
根據設定，使徒擁有“生命之果”，所以有強韌的生命力、自我修復能力，以及強大的絕對領域（A.T.力場）人類則擁有“智慧之果”，所以擁有文明與科技，卻因為沒有強大的絕對領域而分裂成好幾個小個體。因為一個星球只會有一個生命之源，再加上亞當比莉莉斯早來，因此可以説使徒才是地球的“正統居民”。
所有的使徒在活動前，都處於長眠的狀態，但在第二次衝擊後，亞當釋放出來的能量使得使徒一個個甦醒過來。甦醒過來的使徒，會因為生物尋找母親的本能去尋找“亞當”。這是它們衝着第3新東京市去的原因。
由於使徒一旦迴歸亞當，就會發動“第三次衝擊”，並拿走地球的生存權，令人類毀滅，與SEELE“由人類掌控第三次衝擊的發動權（即‘人類補完計劃’）”的目的不符，因此需要由他們的執行單位NERV替他們剷除所有阻礙他們計劃的使徒。
使徒的目的並不是攻擊人類，他們行動的唯一準則是迴歸亞當。但只要使徒迴歸亞當，必然會引發第三次衝擊，所以人類才會去加以阻撓。
攻擊人類是為了獲取人類的資源，吸收進去以增強自身實力，讓他們種族更強大。所以第三新東京市建立的在莉莉絲的上層的目的，本身就是為了吸引使徒，並將它們全部消滅。
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