出發在三層樓。
一層是到達層，二層是M層即通往停車場，三層樓即為出發層。
2017年8月1日起，中國東方航空在上海虹橋機場的國內航班值機櫃台關閉時間調整為航班計劃離港時間前40分鐘。
除此之外，上海虹橋國際機場2號航站樓其它航空公司以及1號航站樓春秋航空的國內航班值機櫃台為航班計劃離港前45分鐘關閉。
虹橋機場出發口在二樓，到達層在一樓，控制區內外都是可以互通的，但轉機旅客只有在航空公司引導員的幫助下通過門禁卡才可以通過，要不就是在禁區外通過樓梯可以互通到達
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