佐助最後離開村子説:謝謝你,但你真的很煩。宇智波佐助離開村子的時候對小櫻説:謝謝你,但你真的很煩。宇智波佐助為了尋求力量,決定追隨大蛇丸,隨後跟隨大蛇丸的手下判出木葉。
漩渦鳴人得知佐助叛逃之後帶領木葉十二小強前去追回宇智波佐助,再發生一系列的戰鬥之後,最終佐助還是來到了大蛇丸的身邊。