玻利維亞聖克魯斯屬温帶氣候。不同的地區氣候各異,東部和中部屬熱帶草原氣候,向西部山地過渡到亞熱帶氣候,內陸高原為山地氣候。玻利維亞雖然有四季之分,但不明顯,春夏為雨季,秋冬為旱季,常年氣候温和。
玻利維亞聖克魯斯的温度:西部山地地區夏季相對涼爽。山地地區冬季時常降霜,並且氣温較低,日氣温最低可達1°C,夜間則為零下。