温州軌道交通S1線運營時間表為:6時20分至22時。嶺站往機場方向首班車發車時間為6時30分,末班車發車時間為21時10分機場站往桐嶺方向首班車發車時間為6時19分,末班車發車時間為21時39分其餘車站首末班車發車時間同步調整。全線行車間隔調整為20分鐘