住院用社會保障卡按醫保卡里錢扣除住院費用的。現在的社會保障卡和醫保卡是同用一個卡,也可以是一卡多用,即能當社會保障卡使用,也可以作為醫保卡使用,因為這一張卡是多個功能來使用,需要用錢可到銀行取就可以了,想看病同樣拿卡就可以,只不過是兩本帳,各算各的帳,各用各的錢吧了。社會保障卡就是這樣扣費的。