二者的主要區別就是在於羊的飼養方式、飼料和羊奶處理過程。
出產有機羊奶的羊是在天然牧場中放養、吃天然牧草長大的,它們所吃的牧草施的也都是天然肥料。只有這樣,有機羊所產的有機羊奶才能最大限度保存它天然營養成分。在羊奶的後期加工中,也不加入防腐劑、抗生素等物質。