以下的八個方面，均為拼音方案的規定，而注音方案沒有這些規定。
1、 zh [ㄓ]、ch [ㄔ]、sh [ㄕ]、r [ㄖ]、z [ㄗ]、c [ㄘ]、s [ㄙ] 七個音節的韻母用i [ㄧ] ，即知、蚩、詩、日、資、雌、思等字寫作zhi、chi、shi、ri、
zi、ci、si 。注音方案則不用韻母，注音輸入法亦直接擊聲母鍵和空格鍵出字。
2、 ien [ㄧㄣ]、ieng [ㄧㄥ] 簡化為in、ing。
3、 i [ㄧ]、in [ㄧㄣ]、ing [ㄧㄥ] 作為獨立音節時前面加y，如yi（衣）、yin（音）、ying（英）。
4、 其他情況下i [ㄧ] 前面無聲母時，i 寫作y ，如ya（呀），ye（耶），yao（腰），you（憂），yan（煙），yang（央），yong（雍）。
5、 u [ㄨ] 作為獨立音節時寫作wu（烏）前面無聲母時，u 寫作w，如wa（蛙），wo（窩），wai（歪），wei（威），wan（彎），wen（温），wang（汪），weng（翁）。
6、漢語拼音jqxy後面的u寫作u， u [ㄩ] 作為獨立音節時寫作yu（魚）前面無聲母時，u 前加y ，如：yuan（淵）、yun（雲）。
7、 iou [ㄧㄡ]、uei [ㄨㄟ]、uen [ㄨㄣ]、ueng [ㄨㄥ]、uen [ㄩㄣ] 前面有聲母時，簡化成iu、ui、un、ong、un。如niu（牛），gui（歸），lun（論）
hong（紅）、jun（軍）。
8、對於“擁”這個音節，拼音方案作iong ，如xiong（兇）如果是獨立音節，則作yong （即上述第4 項規定）。而注音方案則作ㄩㄥ ，相當於ueng
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