三清山旅遊最佳時間是每年的4、5、9、10月。此時，三清山的自然風光最美，此間氣温在攝氏20度上下，在三清山海拔1600米以上的山上氣温較山下低3-5度。
另外建議別在雨天去爬山，一則路滑，二則山頂會有大霧，什麼也看不見，也不要在天氣炎熱的時候去爬山，一則體力消耗太大。
三清山風景區每年以春節、勞動節、暑假、國慶節為旅遊旺季，一旦旺季到來，所有吃、住、行價格會上漲50％到100％左右，而且很有可能找不到住的地方，建議大家儘量避開這些時候去。
一、杜鵑季（5月底-6 月初）
滿山遍野的花海，女神峯至玉台一帶、風門至玉京峯一帶以及流霞台至西海岸一帶均有大片杜鵑林，還能看到的漂亮的雲海、晚霞和日出
二、秋季中旬（10 月中旬）
每到10月中旬，三清山五彩斑斕，層林盡染，三清山南清園、西海岸、陽光海岸、三清福地等植被豐富，都是觀賞秋色的最佳去處。此時也是觀日出，賞雲霧奇景的好時候，而少見的佛光也會時時出現。
三、冬季（12 月-2 月）
冬季的三清山冰清玉潔，日照雲海，冰掛雪景，很是震撼。
一年來一次三清山看到的美景是不全面的，據説三進三清才能看明白這座山。
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