佳能EOS 6D有11個自動對焦點。
佳能EOS 6D採用11點自動對焦感應器,在這個對焦系統中只有中央對焦點為十字型。中央對焦點配製了一個F5.6十字型感應器和一個一字F2.8感應器,即中央對焦點是十字加一字的配製中央對焦點在暗光下可對焦界限達到了-3EV,這一數值超過了EOS 1D X的-2EV水平。