1、繁殖方法不同
扦插苗是通過扦插技術進行繁殖的苗株，即選用植物的枝條、莖幹、根部或者葉子作為插穗，將其插入苗牀上，而原生苗是通過播種的方式繁殖的，播種後覆土不能過深，以免影響出芽率。
2、成活率不同
扦插苗的成活率沒有原生苗的成活率高，因為扦插對於技術和環境的要求比較高，例如扦插的深度、插穗的生命力、周圍環境的温度、濕度、光照等，都會影響插穗的成活率，而種子在催芽後很容易發芽。
3、生長力不同
扦插苗的生長力沒有原生苗的生長力強，扦插苗屬於是二次生根，其根系生長的比較稀疏且細弱，主根的長勢不強，而原生苗的根系發達，生長速度也相對較快。
4、品種純度不同
大部分的扦插苗都能保持其母株的優良特性，苗株成活後擁有和母株一樣的外形，能夠正常開花、結果，品種的純度較高，而原生苗在繁殖過程中容易發生變異，影響開花和結果，純度較低。
原生苗又叫實生苗，直接由種子繁殖的苗木。包括播種苗、野生實生苗以及用上述兩種苗木經移植的移植苗。扦插苗是通過扦插技術培育的苗木，這是無性繁殖的一種，是取它的枝條，然後截成小段，將枝條插入土壤中使其慢慢生根，長成一棵新的苗木。
實生苗培育符合樹木自然生長髮育規律，根系完整，在採用科學的育苗技術措施下，苗木生長整齊健壯、根系發達、壽命較長等特點用作繁殖材料時來源豐富，方法簡便，成本低廉。因而實生繁殖迄今仍是植物栽培中最主要的育苗方法。移栽苗：經過一次或者多次移栽過的苗！
對不易產生種子、又易扦插生根的花卉，多采用扦插繁殖，很多花灌木和地被植物多采用扦插繁殖。它的優點是保持母體的優良特性，繁殖速度快。扦插法培育的植株比播種苗生長快，短時間內可以培育成大苗，尤其是一些不易開花的植物，對觀花植物而言，可以提早開花但扦插苗無主根，根系較播種苗弱。如紫薇、木槿、繡球花、紅葉石楠、小葉女貞、月季、紅花_木等。扦插可以剪取植物的莖、葉、根、芽等（在園藝上稱插穗），或插入土中、沙中，或浸泡在水中，等到生根後就可栽種，使之成為獨立的新植株。在農林業生產中，不同植物扦插時對條件有不同需求。瞭解和順應它們的需求，才能獲得更高的繁殖成功率。
原生高壓是在健康枝條上環剝高壓枝條繁殖苗木，扦插是把健康木質化枝條剪成15到30釐米長的插穗插入基質土或者河沙繁殖苗子。
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