持有股份比例應該是實繳出資,認繳出資的持股比例是股東事先約定的,那麼,股東在出資時應該按照認繳的比例完成出資,這樣才能按照約定的股權比例來對企業實施管理和控制,如果有些股東沒有按照認繳比例出資,那就應該按照實繳出資比例來認定持有股份比例。