巡撫衙門，是一個機構名稱，各省巡撫之辦事機構。
巡撫，官名。中國明清時地方軍政大員之一。又稱撫台。巡視各地的軍政、民政大臣。清代巡撫主管一省軍政、民政。以“巡行天下，撫軍按民”而名。清代，地方大員的品級為:總督，兼都察院右都御史銜，正二品，加兵部尚書銜，從一品巡撫，兼都察院右副都御史銜，從二品，加兵部侍郎銜，正二品。
古代巡撫的府衙叫什麼
叫巡撫衙門。
清代各省巡撫衙門的情況，大體與總督衙門相類似，衙門內不置額定的朝廷命官而專用吏員，但有時也調用候補佐雜官員及武弁以臨時任使， 然非定製。巡撫衙門之內部組織機構亦無定製，但其辦事吏員也存在着專業分工。清末官制改革後，於光緒三十三年（1907）奏訂各省官制通則，規定各省總督及巡撫衙門各設幕職佐理文牘，分科治事。其幕職員數、職掌為：設祕書員一人，承巡撫之命，掌理機密摺電函牘，凡不屬各科之事，皆隸之設交涉科、吏科、民科、度支科、禮科、學科、軍政科、法科、農工商科、郵傳科，各科設參事員一人，承巡撫之命，就主管事務掌理各項文牘祕書員、參事員不作為官缺，統由巡撫自行徵辟，毋庸拘定官階大小，每年將各員銜名及到差年月，分別奏諮存案祕書員、參事員以下，應酌設助理及繕寫等人員，均由巡撫酌定，毋庸奏諮
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