卵胚和囊胚的區別，首先培養時間不同，相對而言，需要培育2到3天的，囊胚需要5到6天的時間其次，穩定性不同。卵胚由於形成的時間短，往往更加不穩定最後，形成順序不同，囊胚是在卵胚的接觸上進行培育的，是一個必經的過程。
區別還在於胚胎的穩定性，由於形成時間較短，因此形態和結構不太穩定，因為卵胚所含細胞數目較少，構成細胞數量較少。
囊胚會比較穩定一些，其組成細胞也很多，可以達到一百多個，所以比較穩定。
培育時間不同 倘若從培育所需要的時間以及程度上來看的話，試管嬰兒所形成的受精卵，一般需要經過2天到3天左右的時間來進行發育，然後才可以形成的，一般這個階段名為胚胎。而囊胚的時間，通常主要屬於培育受精卵到5天，又或者6天，這個時候才才可以形成。因此，胚胎以及囊胚的形成時間方面是存在明顯的區別的。
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穩定性不同 胚胎以及囊胚的區別，往往還在於它們的穩定性不同。胚胎由於形成的時間往往是比較短的，因此不管是形態上，還是結構上，通常都是十分不穩定的。由於胚胎所包含的細胞個數，通常都是比較少的，亦即所組成的細胞是十分少的。而囊胚一般相對而言會比較穩定一些，而胚胎所組成的細胞通常也是十分多的，往往能夠達到了100多個，因此相對而言，會比較穩定一些。
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形成順序不同 胚胎以及囊胚，這兩種物質，屬於試管嬰兒在培育的過程中不同的
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