飛機上的馬桶可以安在家裏的，沖水馬桶會有一個計算機沖水控制組件（FCU）來控制過程，當按下衝水按鈕後，會啟動一個沖水循環。
FCU發送信號給真空泵工作開始工作，1秒後清洗活門打開清洗馬桶，0.7秒後清洗活門關閉，這期間控制8盎司的水進入馬桶，0.3秒後打開沖刷活門，沖刷活門打開4秒排放污物，然後關閉，真空泵再工作9秒鐘停止工作，這樣一個15秒的循環完成，準備進入下一個循環
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