1、科屬區別:喙頭蜥屬於兩棲綱有尾目,蜥蜴則屬於爬行綱蜥蜴目。
2、外觀區別:喙頭蜥的體表沒有鱗片,蜥蜴的身體表面有鱗片。
3、生活環境區別:喙頭蜥一般生活在靠近水的地方,至少也需在空氣濕潤的地方。蜥蜴對水的依賴性比較弱,在沙漠中也能生活。
4、變色能力區別:喙頭蜥無變色能力,但蜥蜴則有這種能力。