海口有三個客輪碼頭。最西邊的是火車輪渡碼頭,是火車與貨車、客車混載輪渡過海。往東緊挨火車輪渡碼頭的是海口新海港碼頭。是貨車、客車混載輪渡過海,碼頭有免税店,買免税品坐船過海,只能選擇在新海港碼頭。
靠近市區的是秀英港碼頭,功能跟新海港碼頭一樣,同時還是海口做大的集裝箱專用碼頭。