珊瑚蟲自身是含有色素的。珊瑚蟲所含的色素分為兩種:熒光色素和非熒光色素。熒光色素中最具代表性的就是綠色熒光蛋白,作用是將有害的紫外線轉化成綠光。因此夜潛的時候用紫色燈照射含有綠色熒光蛋白的珊瑚,則會看到綠色熒光。而非熒光色素,則是將一部分強光反射來保護自身。