依據不同
項目管理單位審核的依據是工程承包合同,尤其是投標書單價、材料設備的價格及其組成,完成的工程數量及質量,工程變更、工程索賠以及工程進展期間雙方履行合同的有關情況等。審計單位的審計依據是國家、地方有關部門頒發的各種財經制度規章、工程規範、定額、工程數量質量及各種手續和資料。
方式不同
項目管理單位審核是在工程從承包合同生效開始,直到工程竣工驗收甚至保修階段結束止。在工程各施工過程均按合同完成之後,將各期付款彙總並進行總體審查,該增的增,該減的減。