迷你鸚鵡魚是體外受精, 親魚會選擇較平整光滑的地方產卵, 可以在飼養缸內放置鯛罐或光滑塑料板供其產卵及受精卵的附着。
親魚會將產卵場地啃食乾淨, 雌魚先將卵產在陶罐內壁, 緊接着雄魚產出精子, 即完成受精。初次繁育的親魚產卵可達100枚左右, 隨着親魚年齡的增加產卵數不斷增加, 個別種魚產卵數可高達400枚左右。
孵化期間由親魚照顧受精卵, 親魚通過不停地煽動魚鰭來提供足夠氧氣供受精卵孵化。