日本的民族構成比較單一，但不能簡單地將其稱作“單一民族國家”。所以這樣説，是因為日本列島上除了人們熟知的“大和人”以外，還生存和繁衍着別具民族特徵的阿依努人和琉球人。
1、大和人亦稱“和人”，是日本民族的主體，約佔總人口的98%以上。大和人屬蒙古人種東亞類型，其系統特徵是頭較短，黃皮膚，黑頭髮，體毛和鬍鬚較少。耳垢為乾性。眼瞼中有被稱作“蒙古襞”的皺襞。血型以A型居多，其他依次為O型、B型、AB型。
大和人原來身材較矮。近年來，大和人的平均身高已有明顯增加。據統計其男人的平均身高已達170釐米左右，在世界上屬於中上水平。
2、阿依努人舊稱“蝦夷人”，屬於千島人種類型。在體形上，阿依努人具有蒙古人種的基本特徵，略微兼有赤道人種的某些特徵：膚色黑黃。體毛濃密，腿長腰闊，
頭大顴高。他們不僅擁有自己的語言——阿依努語，而且還具有獨特的文學和獨特的音樂和舞蹈。阿依努人信奉一種帶有濃厚的薩滿教色彩的宗教，經常舉行“熊祭”、“鯨祭”等宗教儀式——這與他們自古以來一直過着以漁獵、採集為主要生存手段的自給自足的生活有密切聯繫。到了現代，阿依努人的上述民族特徵已經所剩無幾，處於被和人逐漸同化的過程之中。
但是，同化現象的出現並不等於阿依努民族的消失。據統計，還約有2.5萬阿依努人集中生活在北海道的膽振、日高等地。
3、琉球人目前約有120萬人，絕大部分生活在日本沖繩縣所在地——琉球羣島。琉球人雖然與大和人同屬蒙古人種，但與大和人相比，他們的身材略矮，眉毛較濃，顴骨稍高。古代琉球人以部落為單位羣居，14世紀時建立了三個小國，1429年由尚巴志統一為琉球王國，與中國結成朝貢冊封關係。17世紀初遭日本薩摩藩侵略並開始受其控制，1879年，琉球被正式納入日本版圖。
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