1、針對的對象不同
祭拜是指在特定的時候朝拜一些人物神明等的傳統，如供奉神靈或祖先，"拜謁"多用於拜訪高級長官或德高望重的人物，是個人之間的拜見。
2、來源不同
祭拜出自范文瀾蔡美彪等《中國通史》第三編第四章：“吐蕃又迫令所有唐人改換服裝，只許每歲元旦日用唐衣冠祭拜祖先，祭畢收藏。”白話譯文：吐蕃又下令逼迫所有的唐人改變服裝，只允許每年元旦用唐時的衣冠祭拜祖先，祭拜完收藏起來。
拜謁出自《史記·袁盎晁錯列傳》：“盎告歸，道逢丞相申屠嘉，下車拜謁，丞相從車上謝袁盎。”白話譯文：袁盎回家的時候，路上碰見了丞相申屠嘉，下車拜見，丞相在車上還禮
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