沒有區別,“北方交通大學”是北京交通大學的曾用名。北京交通大學1921年參與合併組建交通大學1923年更名為北京交通大學1970年恢復使用“北方交通大學”校名2003年恢復使用“北京交通大學”校名。
是同一所大學不同時期的名稱而已。現在的北京交通大學在以前的某一個時間段內名字叫北方交通大學。後來在上世紀九十年代,更名北京交通大學,直到現在。