珍珠鳥只有一種顏色，青藍灰色 。每隻珍珠鳥的這些顏色分佈不一樣，從而可以區別個體。
珍珠鳥體長大約10釐米左右。全體羽色青藍灰色，雌雄鳥羽色有明顯的區別，易於識別。珍珠鳥的頭部呈藍灰色，嘴基的兩側及兩眼下方，均有黑色的羽紋，眼先為白色，嘴基及眼下方黑羽之間，彷彿是眼下“淚痕”。喉和胸淺灰藍色，背、肩及翅等藍、灰棕色。飛羽深灰褐色，尾羽較短，多為黑色，常被長的尾上覆羽所遮蓋，尾羽並有較規則的白色橫紋，故亦名斑馬雀。嘴多為深紅色，跗蹤及足也為深肉紅色
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