星漢燦爛中的何昭君會在地窖裏的原因是:何昭君全家被雍王父子全部殺死,為了保住家族血脈,何家人就把何昭君和她的弟弟放進了地窖中,這才讓他們姐弟獲得了一個倖存的結局,可以説因為何昭君父親不願意附逆,這才導致了家族被雍王父子殺死。