水蛇孵化前，先將孵化牀移至到陰涼、通風的地方，在室內或室外均可，但不能放到太陽光直接照射的地方。
孵化牀內先鋪墊30釐米厚，經過消毒處理的沙土或新鮮土，土的濕度以手握成團，揚手能散開為好。
將蛇卵橫排於缸底的土面上，在缸底放置一碗水，可起到改善缸內濕度的作用。切忌豎直排放蛇卵，會影響正常的出殼率，嚴重的會導致幼蛇死於卵殼內。
蛇卵一般排放到約離孵化牀30釐米為宜，再在蛇卵上面覆蓋一些雜草或青藤，最後將用木板蓋好或用紗窗網蓋好，沿缸沿用細繩紮緊，以防老鼠、蠍子、螞蟻等小動物對蛇卵的侵害。
在孵化牀吊掛一支幹濕温度計，每週檢查2-3次，温度要保持在20-30℃，相對濕度為60%-80%。
宜將孵化牀移到陽光下涼曬，但不能讓蛇卵接受直接暴曬。每隔7-10天將蛇卵翻動一次。若天氣悶熱，可2-3天翻卵1次。如果發現未受精卵或變質卵，應及時將其揀出。
不同蛇類的孵化時間各不相同，也與孵化條件有直接關係。在產出蛇卵後，如孵化條件適宜，那麼需要耗時一般在30-90天不等，比如眼鏡蛇47-57天，百花錦蛇40-55天，烏梢蛇45-50天。
孵出前的仔蛇具有卵齒，能在出殼前將卵殼劃開一道細縫，大約30-60分鐘後，仔蛇便由裂縫處鑽出卵殼外。當發現蛇卵殼有裂縫時，最好將其挑選出來，另外存放在盛有底層土的陶缸或木箱內，既能避免仔蛇被擠壓致死的現象，又可使仔蛇很快鑽進濕土中藏身。
水蛇2年性成熟，卵胎生，產仔期在4-7月份。8～9月產仔蛇3～13條，初生仔蛇全長100～150 mm。人工養殖水蛇需要在每年的冬季、春季引進不胖不瘦的蛇作為種用，來滿足養蛇場對蛇苗的需求，選擇母蛇的時候一定要挑選那些水蛇品種突出的母蛇作為種用，以免品種退化嚴重，導致養殖效益下降。
水蛇的交配大都在出蟄後到5、6月之間進行，例如眼鏡蛇、蝮蛇在5月交配，黑眉錦蛇、銅腹水蛇、草原響尾蛇在5、6月交配。產卵絕大多數在6～8月，大多數的蛇不會做窩，卵一般產在不冷不熱、不幹不濕、温濕度適宜於孵化的隱蔽場所，獲得的熱量（來自太陽光或莖葉腐爛）足夠供胚胎髮育的地方。而水蛇是一種卵胎生的蛇類，它們在母蛇肚子裏面孵化成熟後，然後從母體爬出來，很多人認為水蛇是產子不是產蛋的，其實，它們在母蛇肚子裏面還是蛇蛋，只不過一個是在體外孵化，一個是在體內孵化而已。
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