缸頭水冷是在汽缸體中循環，有水泵和散熱器，水冷踏板摩托車還要有冷卻風扇。效果自然是缸內冷卻好，缸頭冷卻是簡化的，優點是結構簡單、成本低。
全水冷，是屬於自然冷卻，冷卻效果不如帶水泵、散熱器和風扇的強製冷卻效果好，特別是高速時更差。
缸頭水冷是指在缸體的一端進行的水冷卻，它的散熱效果不是太理想，但結構比較簡單，而全水冷則是缸頭和缸體全部水循環冷卻，冷卻效果極佳，結構比較複雜，維修難度也高。
主要區別是:
1、採用缸頭水冷的發動機，機械結構比全水冷的發動機要簡單，運行部件少，故障率更低，維護保養也更方便
2、缸頭水冷在散熱效率上確實不及全水冷的方式
3、缸頭水冷與全水冷相比成本更低，結構簡單。全水冷的成本更高，價格也更貴一些
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