1、科屬不同
牡丹花,是毛茛科、芍藥屬植物,為多年生落葉灌木。
水仙花,是石蒜科多年生草本植物。
2、形態特徵不同
牡丹花,莖高達2米分枝短而粗。葉通常為二回三出複葉,偶爾近枝頂的葉為3小葉頂生小葉寬卵形,表面綠色,無毛,背面淡綠色,有時具白粉,側生小葉狹卵形或長圓狀卵形,葉柄長5-11釐米,和葉軸均無毛。花單生枝頂,苞片5,長橢圓形萼片5,綠色,寬卵形,花瓣5或為重瓣,玫瑰色、紅紫色、粉紅色至白色,通常變異很大,倒卵形,頂端呈不規則的波狀花葯長圓形,長4毫米花盤革質,杯狀,紫紅色心皮5,稀更多,密生柔毛。蓇葖長圓形,密生黃褐色硬毛。花期5月果期6月。
水仙花,鱗莖卵球形。葉寬線形,扁平,鈍頭,全緣,粉綠色。花莖幾與葉等長花梗長短不一花被管細,灰綠色,近三稜形,擴展,白色,芳香副花冠淺杯狀,淡黃色,不皺縮花柱細長,柱頭3裂。蒴果室背開裂。花期春季。花序軸由葉叢抽出,綠色,圓筒形,中空外表具明顯的凹凸稜形,表皮具蠟粉花白色,芳香花期1-2月。