昌吉市沒有火車站,要坐火車需要去烏魯木齊坐,烏魯木齊市有四個火車站,西站,東站主要用於貨運,南站已經停運,目前在運行的是烏魯木齊站,離昌吉市最近的也就是新站烏魯木齊站,在頭屯河區高鐵北六路1號,是蘭新高速鐵路的西端終點,是新疆最大的綜合交通樞紐、鐵路客運集散地。