两者区别如下
电子束灭菌技术 ，是一种应用β射线辐照灭菌的灭菌技术。是由电子加速器产生的3MeV～5MeV (百万电子伏特)能量的高速电子束进行杀灭微生物的方法。电子束直接与细胞核DNA作用，切断DNA分子键，或与细胞中的水分产生发生化学反应，形成活性状态，作用到细胞内高分子上使其产生繁殖障碍。
eo灭菌是医院和实验室等常用的低温灭菌方式，现在也经常用来对口罩等防护用品灭菌.环氧乙烷杀菌广谱，穿透性强，灭菌效果好
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