灵魂有三种功能：运动、感觉和思辩。生命体大多具有运动的功能，唯有人类具有理知灵魂，可以做实践思想和纯理思想，其他动植物只具备感觉灵魂。动物的感觉（色、声、味、触、嗅）有自己的限度，感觉就像是一个屏幕，实现着世界到灵魂的第一层过滤。
主动心识与被动心识
人类所独具的理知灵魂蕴含了上承神天，下接草木鱼虫世界的心理间体。因此人类可以凭借理性所开启的伦理和道德，调伏由感觉与身体机能所引发的兽性和贪欲。
亚里士多德在解剖时，把一些神经束误认为是肌腱，所以把感觉系统归之于心脏。而他的老师柏拉图之前已经认为这部分归于脑部。
亚里士多德的这个错误，也发生在中国和印度的贤哲身上。如“道心唯微，人心唯危”“运用之妙，在于一心”“制心一处”，这些心都是从心脏的“心”所引申。而理知之心，在“脑”不在“心脏”。
动物的欲望与臆想有关，而臆想属于感觉，不只人有，动物们也会参与其中。这些臆想驱动着欲望和情绪，都属于被动心识。而理知作为主动心识，可以控制人类的行为，做出不一样的选择。
心识就如同光，可以把潜在的色，照成现实的色。柏拉图认为“学习是回忆的过程”，学习的知识便如“现实的色”，这些知识通过主动心识的作用，又可以影响到“潜在的色”，潜在的知识重新被处理，以另一种面貌影响现实。
亚里士多德根据活动能力将灵魂分成了从低到高的三部分：营养的灵魂、感觉 的灵魂和理性的灵魂。
高级的灵魂包含着较低级的灵魂。营养的灵魂主要是植物所 具有的，感觉的灵魂主要为动物所具有，而理性灵魂则只有人才具有。
亚里士多德 认为这三部分或三种灵魂的共同点在于都是一种能力。总结性地来说，亚里士多德 认为不是一种实体，而是能力，而且灵魂的大部分要依赖于身体，是随着身体的灭 亡而灭亡，这个观点是唯物主义的，但是他关于理性与躯体分开是不死的观点却是 唯心主义的，是灵魂转世说的残余。
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