綠松石所獨有的顏色是由於其體內所含的致色離子而呈現出來的,當綠松石內所含的銅離子越多,則趨向於藍色當綠松石內所含的鐵離子越多,則趨向於綠色。
所以,綠松石按顏色可以分爲三大類:藍色系,綠色系、灰(白)色系。其價值,則是天藍色的綠松石最好,其次爲深藍色、藍綠色和淺灰藍色,顏色越均衡越好。
許多優質的綠松石亦經過表面的某些優化來穩定綠松石的顏色,有些穩定是必要的,且獲得國際範圍的行業認可。
更多見的則是透過染色、再造(將太淺和太軟的綠松石磨成粉末,加入樹脂,重新做出綠松石來,可見褐鐵礦脈線)等處理方式來人爲改變綠松石的性狀,這些綠松石價值就很低了。