等位基因（allele），是指位於一對同源染色體相同位置上控制同一性狀不同形態的基因
非等位基因就是位於同源染色體的不同位置上或非同源染色體上的基因，如：高莖基因D與紅花基因C。
註釋：同源染色體是在二倍體生物細胞中，形態、結構基本相同的染色體，並在減數第一次分裂（參考減數分裂）的四分體時期中彼此聯會（若是三倍體及其他奇數倍體生物細胞，聯會時會發生紊亂），最後分開到不同的生殖細胞（即精子、卵細胞）的一對染色體，在這一對染色體其中的一條來自母方，另一條來自父方
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