1、是兩個不同的行政區域。巴南是巴南區，南岸是南南區。
2、地理位置不同。巴南和南岸都在長江以南，但巴南更在南岸的南面。
3、面積不同。巴南區比南岸區面積大一些。
區別如下：
第一，名稱不一樣，分別是巴南區和南岸區
第二，行政單位不一樣，巴南區和南岸區是重慶市管轄的兩個獨立的區，這兩個區之間沒有行政管理關係，他們是相互獨立的，都歸重慶市政府直接管理。
巴南區原稱巴縣，90年代以前屬於江津地區管轄，劃歸重慶行政管轄後，巴縣後改名巴南區。南岸區則是重慶最早九區之一，位於長江南岸，與渝中區隔長江相望
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