花生麸需要腐熟才能作为有机肥施用，腐熟过程应该在缺氧的环境中进行。
发酵以前，先将花生麸粉碎成粉末，有利于加快腐熟速度。常规的办法是将花生麸粉和水按照1:15左右的比例混合，经常搅拌，经过2-12 个月后就可以完全腐熟，夏季温度较高，腐熟速度快，低温条件下，腐熟时间较长。如果加入蔗糖，可以加快腐熟速度。
腐熟以后的液态肥还需要再次稀释，稀释的比例为1:7。如果不经过腐熟，会产生大量的热量，产生烧种或者烧根现象，作为叶面肥时，会烧伤叶片。
花生麸也可以利用密闭的容器加入适量的田园土拌匀以后加水堆沤成堆肥，但要注意老鼠等偷吃，也需要盖紧表层，防止臭味扩散。在腐熟过程中注意经常加水，防止冒烟，腐熟以后的堆肥有大量的白色丝状物。完全腐熟的花生麸肥，可以作为基肥和追肥使用。
腐熟的花生麸主要成分为磷钾肥，营养价值较高，主要用于果树栽培，也可用于蔬菜、花卉和其它农作物。花生麸的营养价值很高，100公斤花生麸相当于13.9公斤尿素+6.5公斤过磷酸钙+3.2公斤氯化钾，还有铁、锌、钙、锰等微量元素，可以有效提高果树的品质和产量。
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