交管12123處理違章如果有駕照扣分的，罰款交了在系統響應之後會自動扣分的。
一般情況下在處理完交通違章的罰款之後，需要扣分的話在系統一定時間之後會自行進行扣分的。電子眼拍攝的違章，可以在交管12123查詢詳細的違章內容及罰款金額，如果金額小於200元那麼可以直接在網上處理違章並繳納罰款。
但如果違章的金額高於200元，並且違章的扣分與之前累積的扣分總和達到了12分，那麼就只能到車管所或者交警隊處理了。違章必須要在規定的時間內處理，否則會收取滯納金。違章沒處理還會影響到駕駛證和行駛證的換證、補領等等業務，並且違章沒處理完也不能進行年審。
在交管12123上處理違章，交了罰款，沒有扣分是因為資料延遲的原因。
交管12123交罰款流程：
第一步，開啟交管12123APP，在首頁中找到【我的違法】並點選開啟
第二步，進入機動車違法選項中可以看到我們自身的汽車車牌號，同時在下方顯示的是【違法未處理】，點選我們的車牌號
第三步，進入個人駕照詳細頁面後，可以看到在【未處理】下面有一個違停的違章，選中這個違章並點選右下角的【處理並繳款】
第四步，點選繳納罰款後會提醒我們電子監控違法處理業務的規則，點選【閱讀並同意】，接下來會進入違章處理的介面，這裡需要輸入手機的驗證碼，點選【確認繳款】
第五步，最後進入的就是支付違章的罰款，點選右下角的【去付款】根據提示完成付款即可。處理過後需要等待一段時間處理違章，處理成功後返回到機動車介面，可以看到車輛狀態顯示為【正常】。
你可以選擇去交警隊查詢。因各地交管網際網路平臺與公安網路資料交換存在“時間差”（通常情況資料交換延時約為一小時），如果已在某個平臺或是渠道自助處理了交通違法，請耐心處理完成及等待資料更新。
根據新規，你是可以在交管123123上自助處理違章的，但只限於3分以及3分以下的違法行為，如果扣分在6分以上的違法行為需要先去本地的大廳處理結果並且列印違法行為的通知單。
如果在交管12123交的罰款，那麼分就是在交款的同時直接就扣掉了。如果沒扣，那就說明這條違法只罰款不扣分。
交管12123是網際網路交通安全綜合服務管理平臺官方客戶端，由公安部交通管理科學研究所提供技術支援。為廣大車主和駕駛人提供: 網際網路服務平臺個人使用者註冊，機動車/駕駛證/違法處理等業務預約、受理和辦理，交通安全資訊查詢、業務告知提醒、業務導辦，道路通行服務等全方位交通安全服務。
平臺開通後將使辦事手續得到簡化，取消業務申請等紙質材料，建立網上提交申請資訊，網下稽核材料、製作牌證、交付寄遞的全新工作機制，推行網上網下綜合服務。破除地域限制，實現全國範圍的跨地域資訊交換和網上服務漫遊，由“服務跟著管轄屬地走”轉變為“服務跟著群眾走”，方便群眾異地辦理相關業務。
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