基因的獨立性可以理解為,每種基因都存在於特定位置的一對同源染色體上,他們各自行使自己的功能,即複製和表達,互不影響。基因不存在排他性的說法,但是因為基因在體內是以雙鏈dna形式存在,且有一套完整的修復機制,所以具有比較高的保守性。
在雜合子細胞中,位於一對同源染色體上的等位基因,具有一定的獨立性當細胞進行減數分裂,等位基因會隨著同源染色體的分開而分離,分別進入兩個配子當中,獨立地隨配子遺傳給後代。基因分離定律與基因自由組合定律、基因的連鎖和交換定律為遺傳學三大定律。