想要判斷熊貓魚的公母，首先可以從體型上判斷，雄性熊貓魚體形一般較長，雌魚的身體較短且圓，尤其是在懷卵期雌魚腹部比雄魚腹部膨大，而且雄魚和雌魚的尾柄也不同，雄魚的尾柄粗壯且相對較長，雌魚的尾柄則比較細弱且短。
熊貓魚的公母在顏色方面也要些許不同，雖然都是黑白兩色，但體色方面有細微的差別，放在一起時雄性熊貓魚的體色更加鮮豔，尤其是在繁殖發育期，雄魚體色更為鮮豔，而雌魚的體色相對比較暗淡，就算是繁殖發育期也不會發生變化。
判斷熊貓魚的公母可以從體型、魚鰭、色澤等方面去觀察。就體型而言，雄性都比雌性略大。雄熊貓魚體形比雌性熊貓魚略長略大，雌性熊貓魚相對短且圓。在魚鰭方面雄魚尾鰭根部較雌魚顯粗壯。在色澤方面，雄性熊貓魚比雌性的顏色更豔麗，惹人眼球。熊貓魚對生存環境要求比較低，容易飼養，所以可以作為廣大養魚愛好者的首選。
判斷方法：
1、公魚的背鰭是黑色條紋和紅色條紋相間，立起來的時候很漂亮，母魚的背鰭只在根部有一點紅色，上面都是黑的。
2、母魚的肚子比較大，嘴向上翹，公魚的體形相對流暢。
3、公魚經常追母魚，但不是追趕，而是總跟在母魚半個身位後，很紳士的樣子。
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