1、對於一般的非法行醫，尚未危害人民生命健康，危害後果不嚴重的，根據《醫療機構管理條例》第四十四條的規定，
“違反本條例第二十四條規定，未取得《醫療機構執業許可證》擅自執業的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令其停止執業活動，沒收非法所得和藥品、器械，並可以根據情節處以1萬元以下的罰款。”
2、若“發生醫療事故的處罰（如病人殘廢了）”，或者“診所開業很久”了， 這就要看是否屬於非法行醫罪，該罪是指未取得醫生執業資格的人非法行醫，爲他人治病，情節嚴重的行爲。 犯本罪的，處三年以下有 期 徒 刑、拘役或者管制，並處或者單處罰金，嚴重損害就診人身體健康的，處三年以上十年以下 有 期 徒 刑，並處罰金造成就診人死亡的，處十年以上有期徒刑，並處罰金。
(一)未取得執業許可證擅自開業的，予以取締，沒收違法所得和藥品、醫療器械，並處以1000元以上10000元以下罰款。(二)不按規定辦理變更登記的，責令其限期補辦手續，並處以50元以上500元以下罰款在限期內仍不辦理變更登記的，吊銷其執業許可證。
(三)擅自招用不符合規定條件人員，責令其限期改正，並處以100元以上5000元以下罰款情節嚴重的，吊銷其執業許可證。(四)擅自改變業務範圍，增加病牀的，予以警告，責令其限期改正，並可處以100元以上3000元以下罰款，情節嚴重的，吊銷其執業許可證。
(五)不遵守有關病人、病情登記、報告制度，或不按規定向衛生行政部門報告業務和帳目收支情況的，責令其限期改正，並處以100元以上3000元以下罰款。
(六)僞造、塗改、轉借執業許可證，推諉、延誤治療，發生醫療事故>瞞不報，以及僞造、塗改、銷燬病案資料或有關證明的，責令其停業整頓，沒收違法所得，並處以500元以上5000元以下罰款情節嚴重的，吊銷其執業許可證。
(七)從事人工授精或擅自進行性病治療的，沒收其違法所得，並處以1000元以上10000元以下罰款情節嚴重的，吊銷其執業許可證。
(八)醫療業務質量低劣，管理不善，內部秩序混亂的，責令其停業整頓整頓無效的，吊銷其執業許可證。
第二十九條 對違反有關防疫、藥品、稅收、物價、計劃生育管理的法律、法規者，分別按有關規定處理。
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