因爲捻軍並沒有一個絕對有力的統治者,捻軍軍的形成是通過會盟而推舉張樂行爲盟主的,他們之間,並沒有極其緊密的關係,張樂行對派系也沒有十足的控制能力,所以在1857年,聯軍內部的藍旗領袖與張樂行意見不合產生了分裂,雖然被張樂行處決,但是大部分捻軍將領率部都回到了淮北老家。
至此捻軍實力大傷,最後分裂不成體系,導致原本有20萬精兵的捻軍後來被逐個擊破,這是後話。